Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sh2d3cQ9QZS8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh2d3cQ9QZS8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh2d3cQ9QZS8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh2d3cQ9QZS8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms