Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc1Q9QZF2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc1Q9QZF2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc1Q9QZF2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms