Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tspan3Q9QY33 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tspan3Q9QY33 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan3Q9QY33 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms