Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nufip1Q9QXX8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nufip1Q9QXX8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nufip1Q9QXX8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nufip1Q9QXX8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nufip1Q9QXX8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nufip1Q9QXX8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nufip1Q9QXX8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nufip1Q9QXX8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nufip1Q9QXX8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nufip1Q9QXX8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nufip1Q9QXX8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nufip1Q9QXX8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nufip1Q9QXX8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nufip1Q9QXX8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nufip1Q9QXX8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nufip1Q9QXX8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms