Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad18Q9QXK2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad18Q9QXK2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad18Q9QXK2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad18Q9QXK2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad18Q9QXK2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad18Q9QXK2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad18Q9QXK2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad18Q9QXK2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad18Q9QXK2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad18Q9QXK2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad18Q9QXK2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad18Q9QXK2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad18Q9QXK2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad18Q9QXK2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad18Q9QXK2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad18Q9QXK2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rad18Q9QXK2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad18Q9QXK2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad18Q9QXK2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad18Q9QXK2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad18Q9QXK2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad18Q9QXK2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad18Q9QXK2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad18Q9QXK2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad18Q9QXK2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad18Q9QXK2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad18Q9QXK2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad18Q9QXK2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms