Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyth1Q9QX11 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyth1Q9QX11 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyth1Q9QX11 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyth1Q9QX11 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyth1Q9QX11 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyth1Q9QX11 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyth1Q9QX11 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyth1Q9QX11 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyth1Q9QX11 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyth1Q9QX11 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyth1Q9QX11 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyth1Q9QX11 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyth1Q9QX11 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyth1Q9QX11 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyth1Q9QX11 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyth1Q9QX11 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyth1Q9QX11 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyth1Q9QX11 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyth1Q9QX11 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyth1Q9QX11 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyth1Q9QX11 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyth1Q9QX11 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyth1Q9QX11 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyth1Q9QX11 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyth1Q9QX11 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyth1Q9QX11 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyth1Q9QX11 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyth1Q9QX11 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyth1Q9QX11 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyth1Q9QX11 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyth1Q9QX11 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyth1Q9QX11 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyth1Q9QX11 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyth1Q9QX11 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyth1Q9QX11 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyth1Q9QX11 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyth1Q9QX11 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyth1Q9QX11 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyth1Q9QX11 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyth1Q9QX11 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyth1Q9QX11 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyth1Q9QX11 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyth1Q9QX11 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyth1Q9QX11 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyth1Q9QX11 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyth1Q9QX11 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyth1Q9QX11 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms