Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PdcQ9QW08 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PdcQ9QW08 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PdcQ9QW08 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PdcQ9QW08 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PdcQ9QW08 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PdcQ9QW08 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PdcQ9QW08 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PdcQ9QW08 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PdcQ9QW08 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PdcQ9QW08 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PdcQ9QW08 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PdcQ9QW08 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PdcQ9QW08 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PdcQ9QW08 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PdcQ9QW08 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PdcQ9QW08 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PdcQ9QW08 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PdcQ9QW08 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PdcQ9QW08 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PdcQ9QW08 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PdcQ9QW08 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PdcQ9QW08 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms