Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh5Q9QUM7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Msh5Q9QUM7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Msh5Q9QUM7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msh5Q9QUM7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms