Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep6Q9JM62 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep6Q9JM62 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep6Q9JM62 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Reep6Q9JM62 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Reep6Q9JM62 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Reep6Q9JM62 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms