Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Irx5Q9JKQ4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Irx5Q9JKQ4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx5Q9JKQ4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx5Q9JKQ4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx5Q9JKQ4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx5Q9JKQ4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx5Q9JKQ4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irx5Q9JKQ4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irx5Q9JKQ4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx5Q9JKQ4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx5Q9JKQ4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx5Q9JKQ4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx5Q9JKQ4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx5Q9JKQ4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx5Q9JKQ4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx5Q9JKQ4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irx5Q9JKQ4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Irx5Q9JKQ4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx5Q9JKQ4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx5Q9JKQ4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx5Q9JKQ4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Irx5Q9JKQ4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Irx5Q9JKQ4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irx5Q9JKQ4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx5Q9JKQ4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx5Q9JKQ4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx5Q9JKQ4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx5Q9JKQ4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx5Q9JKQ4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irx5Q9JKQ4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Irx5Q9JKQ4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irx5Q9JKQ4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irx5Q9JKQ4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irx5Q9JKQ4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx5Q9JKQ4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms