Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pole3Q9JKP7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pole3Q9JKP7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pole3Q9JKP7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms