Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nova1Q9JKN6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nova1Q9JKN6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nova1Q9JKN6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nova1Q9JKN6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nova1Q9JKN6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nova1Q9JKN6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nova1Q9JKN6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nova1Q9JKN6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nova1Q9JKN6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nova1Q9JKN6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nova1Q9JKN6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nova1Q9JKN6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nova1Q9JKN6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nova1Q9JKN6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nova1Q9JKN6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nova1Q9JKN6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nova1Q9JKN6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nova1Q9JKN6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nova1Q9JKN6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nova1Q9JKN6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nova1Q9JKN6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nova1Q9JKN6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nova1Q9JKN6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nova1Q9JKN6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nova1Q9JKN6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nova1Q9JKN6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nova1Q9JKN6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms