Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp39a1Q9JKJ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp39a1Q9JKJ9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp39a1Q9JKJ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp39a1Q9JKJ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp39a1Q9JKJ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms