Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gfra4Q9JJT2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gfra4Q9JJT2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gfra4Q9JJT2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gfra4Q9JJT2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gfra4Q9JJT2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gfra4Q9JJT2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gfra4Q9JJT2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gfra4Q9JJT2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gfra4Q9JJT2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gfra4Q9JJT2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gfra4Q9JJT2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gfra4Q9JJT2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gfra4Q9JJT2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gfra4Q9JJT2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gfra4Q9JJT2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gfra4Q9JJT2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gfra4Q9JJT2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gfra4Q9JJT2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gfra4Q9JJT2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gfra4Q9JJT2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gfra4Q9JJT2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gfra4Q9JJT2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gfra4Q9JJT2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gfra4Q9JJT2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gfra4Q9JJT2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gfra4Q9JJT2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gfra4Q9JJT2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gfra4Q9JJT2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gfra4Q9JJT2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gfra4Q9JJT2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gfra4Q9JJT2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gfra4Q9JJT2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gfra4Q9JJT2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gfra4Q9JJT2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gfra4Q9JJT2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gfra4Q9JJT2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gfra4Q9JJT2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gfra4Q9JJT2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gfra4Q9JJT2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gfra4Q9JJT2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gfra4Q9JJT2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gfra4Q9JJT2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gfra4Q9JJT2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gfra4Q9JJT2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gfra4Q9JJT2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gfra4Q9JJT2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gfra4Q9JJT2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gfra4Q9JJT2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gfra4Q9JJT2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gfra4Q9JJT2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gfra4Q9JJT2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gfra4Q9JJT2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gfra4Q9JJT2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gfra4Q9JJT2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gfra4Q9JJT2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gfra4Q9JJT2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gfra4Q9JJT2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gfra4Q9JJT2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms