Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC9

Herpud2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud2Q9JJC9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herpud2Q9JJC9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herpud2Q9JJC9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herpud2Q9JJC9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Herpud2Q9JJC9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Herpud2Q9JJC9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Herpud2Q9JJC9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Herpud2Q9JJC9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herpud2Q9JJC9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herpud2Q9JJC9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herpud2Q9JJC9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herpud2Q9JJC9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herpud2Q9JJC9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herpud2Q9JJC9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Herpud2Q9JJC9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Herpud2Q9JJC9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Herpud2Q9JJC9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Herpud2Q9JJC9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Herpud2Q9JJC9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Herpud2Q9JJC9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Herpud2Q9JJC9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Herpud2Q9JJC9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Herpud2Q9JJC9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Herpud2Q9JJC9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms