Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cog8Q9JJA2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cog8Q9JJA2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cog8Q9JJA2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cog8Q9JJA2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cog8Q9JJA2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cog8Q9JJA2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cog8Q9JJA2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cog8Q9JJA2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cog8Q9JJA2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cog8Q9JJA2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cog8Q9JJA2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cog8Q9JJA2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cog8Q9JJA2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cog8Q9JJA2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cog8Q9JJA2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog8Q9JJA2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog8Q9JJA2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog8Q9JJA2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog8Q9JJA2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog8Q9JJA2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog8Q9JJA2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cog8Q9JJA2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cog8Q9JJA2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cog8Q9JJA2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cog8Q9JJA2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cog8Q9JJA2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cog8Q9JJA2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cog8Q9JJA2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cog8Q9JJA2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cog8Q9JJA2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cog8Q9JJA2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cog8Q9JJA2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cog8Q9JJA2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cog8Q9JJA2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cog8Q9JJA2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cog8Q9JJA2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cog8Q9JJA2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cog8Q9JJA2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cog8Q9JJA2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cog8Q9JJA2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cog8Q9JJA2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cog8Q9JJA2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cog8Q9JJA2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cog8Q9JJA2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cog8Q9JJA2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cog8Q9JJA2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cog8Q9JJA2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cog8Q9JJA2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cog8Q9JJA2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cog8Q9JJA2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cog8Q9JJA2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cog8Q9JJA2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cog8Q9JJA2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cog8Q9JJA2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cog8Q9JJA2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cog8Q9JJA2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cog8Q9JJA2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cog8Q9JJA2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cog8Q9JJA2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cog8Q9JJA2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cog8Q9JJA2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms