Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Slc5a4aQ9ET37 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc5a4aQ9ET37 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc5a4aQ9ET37 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc5a4aQ9ET37 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc5a4aQ9ET37 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc5a4aQ9ET37 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc5a4aQ9ET37 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc5a4aQ9ET37 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc5a4aQ9ET37 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc5a4aQ9ET37 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc5a4aQ9ET37 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slc5a4aQ9ET37 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slc5a4aQ9ET37 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc5a4aQ9ET37 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc5a4aQ9ET37 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc5a4aQ9ET37 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc5a4aQ9ET37 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc5a4aQ9ET37 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc5a4aQ9ET37 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc5a4aQ9ET37 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms