Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pgpep1Q9ESW8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Pgpep1Q9ESW8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pgpep1Q9ESW8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pgpep1Q9ESW8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pgpep1Q9ESW8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pgpep1Q9ESW8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Pgpep1Q9ESW8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pgpep1Q9ESW8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pgpep1Q9ESW8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pgpep1Q9ESW8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pgpep1Q9ESW8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pgpep1Q9ESW8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pgpep1Q9ESW8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pgpep1Q9ESW8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pgpep1Q9ESW8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pgpep1Q9ESW8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pgpep1Q9ESW8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pgpep1Q9ESW8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgpep1Q9ESW8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgpep1Q9ESW8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgpep1Q9ESW8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgpep1Q9ESW8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgpep1Q9ESW8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgpep1Q9ESW8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Pgpep1Q9ESW8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Pgpep1Q9ESW8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Pgpep1Q9ESW8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Pgpep1Q9ESW8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Pgpep1Q9ESW8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgpep1Q9ESW8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms