Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESQ8

Npvf, Pro-FMRFamide-related neuropeptide VF, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpvfQ9ESQ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpvfQ9ESQ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NpvfQ9ESQ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NpvfQ9ESQ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NpvfQ9ESQ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NpvfQ9ESQ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NpvfQ9ESQ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NpvfQ9ESQ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NpvfQ9ESQ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NpvfQ9ESQ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NpvfQ9ESQ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NpvfQ9ESQ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NpvfQ9ESQ8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NpvfQ9ESQ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NpvfQ9ESQ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NpvfQ9ESQ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms