Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
OtofQ9ESF1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OtofQ9ESF1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OtofQ9ESF1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
OtofQ9ESF1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
OtofQ9ESF1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
OtofQ9ESF1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
OtofQ9ESF1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
OtofQ9ESF1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
OtofQ9ESF1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
OtofQ9ESF1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
OtofQ9ESF1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OtofQ9ESF1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OtofQ9ESF1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OtofQ9ESF1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OtofQ9ESF1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
OtofQ9ESF1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OtofQ9ESF1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OtofQ9ESF1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OtofQ9ESF1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OtofQ9ESF1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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