Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ush1cQ9ES64 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ush1cQ9ES64 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ush1cQ9ES64 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ush1cQ9ES64 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms