Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RhojQ9ER71 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RhojQ9ER71 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RhojQ9ER71 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RhojQ9ER71 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RhojQ9ER71 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RhojQ9ER71 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RhojQ9ER71 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RhojQ9ER71 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RhojQ9ER71 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RhojQ9ER71 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RhojQ9ER71 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RhojQ9ER71 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RhojQ9ER71 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RhojQ9ER71 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RhojQ9ER71 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RhojQ9ER71 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RhojQ9ER71 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RhojQ9ER71 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RhojQ9ER71 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RhojQ9ER71 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RhojQ9ER71 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RhojQ9ER71 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RhojQ9ER71 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RhojQ9ER71 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RhojQ9ER71 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RhojQ9ER71 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RhojQ9ER71 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RhojQ9ER71 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RhojQ9ER71 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms