Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Clstn2Q9ER65 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Clstn2Q9ER65 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Clstn2Q9ER65 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Clstn2Q9ER65 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Clstn2Q9ER65 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Clstn2Q9ER65 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Clstn2Q9ER65 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Clstn2Q9ER65 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Clstn2Q9ER65 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Clstn2Q9ER65 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Clstn2Q9ER65 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Clstn2Q9ER65 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Clstn2Q9ER65 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Clstn2Q9ER65 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Clstn2Q9ER65 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Clstn2Q9ER65 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Clstn2Q9ER65 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Clstn2Q9ER65 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Clstn2Q9ER65 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Clstn2Q9ER65 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Clstn2Q9ER65 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Clstn2Q9ER65 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Clstn2Q9ER65 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Clstn2Q9ER65 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Clstn2Q9ER65 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Clstn2Q9ER65 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Clstn2Q9ER65 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms