Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cmtr1Q9DBC3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cmtr1Q9DBC3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cmtr1Q9DBC3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cmtr1Q9DBC3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cmtr1Q9DBC3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cmtr1Q9DBC3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cmtr1Q9DBC3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cmtr1Q9DBC3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cmtr1Q9DBC3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cmtr1Q9DBC3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cmtr1Q9DBC3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cmtr1Q9DBC3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cmtr1Q9DBC3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cmtr1Q9DBC3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cmtr1Q9DBC3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cmtr1Q9DBC3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cmtr1Q9DBC3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cmtr1Q9DBC3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cmtr1Q9DBC3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cmtr1Q9DBC3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cmtr1Q9DBC3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cmtr1Q9DBC3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cmtr1Q9DBC3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cmtr1Q9DBC3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cmtr1Q9DBC3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cmtr1Q9DBC3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cmtr1Q9DBC3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cmtr1Q9DBC3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cmtr1Q9DBC3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cmtr1Q9DBC3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms