Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Med29Q9DB91 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med29Q9DB91 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Med29Q9DB91 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Med29Q9DB91 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Med29Q9DB91 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Med29Q9DB91 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med29Q9DB91 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med29Q9DB91 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med29Q9DB91 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med29Q9DB91 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med29Q9DB91 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med29Q9DB91 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med29Q9DB91 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med29Q9DB91 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med29Q9DB91 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med29Q9DB91 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Med29Q9DB91 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Med29Q9DB91 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med29Q9DB91 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med29Q9DB91 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med29Q9DB91 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med29Q9DB91 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med29Q9DB91 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med29Q9DB91 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med29Q9DB91 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med29Q9DB91 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med29Q9DB91 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med29Q9DB91 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med29Q9DB91 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med29Q9DB91 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms