Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cab39lQ9DB16 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cab39lQ9DB16 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cab39lQ9DB16 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cab39lQ9DB16 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cab39lQ9DB16 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cab39lQ9DB16 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cab39lQ9DB16 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cab39lQ9DB16 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cab39lQ9DB16 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cab39lQ9DB16 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cab39lQ9DB16 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cab39lQ9DB16 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cab39lQ9DB16 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cab39lQ9DB16 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cab39lQ9DB16 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cab39lQ9DB16 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cab39lQ9DB16 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cab39lQ9DB16 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cab39lQ9DB16 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cab39lQ9DB16 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cab39lQ9DB16 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms