Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrmuQ9DAT5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrmuQ9DAT5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrmuQ9DAT5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrmuQ9DAT5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrmuQ9DAT5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrmuQ9DAT5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrmuQ9DAT5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrmuQ9DAT5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrmuQ9DAT5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrmuQ9DAT5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrmuQ9DAT5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrmuQ9DAT5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrmuQ9DAT5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrmuQ9DAT5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrmuQ9DAT5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrmuQ9DAT5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TrmuQ9DAT5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TrmuQ9DAT5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TrmuQ9DAT5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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