Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD6

Pfn3, Profilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn3Q9DAD6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfn3Q9DAD6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfn3Q9DAD6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfn3Q9DAD6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pfn3Q9DAD6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pfn3Q9DAD6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pfn3Q9DAD6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pfn3Q9DAD6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfn3Q9DAD6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms