Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Calr3Q9D9Q6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Calr3Q9D9Q6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Calr3Q9D9Q6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms