Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam3aQ9D8T0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam3aQ9D8T0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam3aQ9D8T0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam3aQ9D8T0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam3aQ9D8T0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam3aQ9D8T0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam3aQ9D8T0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam3aQ9D8T0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam3aQ9D8T0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam3aQ9D8T0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam3aQ9D8T0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam3aQ9D8T0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam3aQ9D8T0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam3aQ9D8T0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam3aQ9D8T0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam3aQ9D8T0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam3aQ9D8T0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam3aQ9D8T0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam3aQ9D8T0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 936.2 ms