Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D8L0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D8L0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D8L0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8L0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8L0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D8L0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8L0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8L0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8L0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8L0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8L0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9D8L0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D8L0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8L0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8L0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8L0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8L0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8L0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8L0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8L0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8L0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D8L0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms