Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W5

Med8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med8Q9D7W5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Med8Q9D7W5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med8Q9D7W5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Med8Q9D7W5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms