Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbe1Q9D6Y9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gbe1Q9D6Y9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbe1Q9D6Y9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbe1Q9D6Y9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbe1Q9D6Y9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbe1Q9D6Y9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbe1Q9D6Y9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbe1Q9D6Y9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbe1Q9D6Y9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbe1Q9D6Y9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbe1Q9D6Y9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms