Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cmtm5Q9D6G9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cmtm5Q9D6G9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cmtm5Q9D6G9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cmtm5Q9D6G9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cmtm5Q9D6G9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cmtm5Q9D6G9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cmtm5Q9D6G9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cmtm5Q9D6G9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cmtm5Q9D6G9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cmtm5Q9D6G9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cmtm5Q9D6G9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cmtm5Q9D6G9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cmtm5Q9D6G9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cmtm5Q9D6G9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cmtm5Q9D6G9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cmtm5Q9D6G9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cmtm5Q9D6G9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cmtm5Q9D6G9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cmtm5Q9D6G9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cmtm5Q9D6G9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cmtm5Q9D6G9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cmtm5Q9D6G9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cmtm5Q9D6G9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cmtm5Q9D6G9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cmtm5Q9D6G9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cmtm5Q9D6G9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cmtm5Q9D6G9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cmtm5Q9D6G9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cmtm5Q9D6G9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cmtm5Q9D6G9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cmtm5Q9D6G9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cmtm5Q9D6G9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cmtm5Q9D6G9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cmtm5Q9D6G9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cmtm5Q9D6G9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cmtm5Q9D6G9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cmtm5Q9D6G9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cmtm5Q9D6G9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cmtm5Q9D6G9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cmtm5Q9D6G9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms