Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D7

Tmem30c, Cell cycle control protein 50C, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30cQ9D4D7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem30cQ9D4D7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem30cQ9D4D7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem30cQ9D4D7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem30cQ9D4D7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem30cQ9D4D7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem30cQ9D4D7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms