Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UvssaQ9D479 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
UvssaQ9D479 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UvssaQ9D479 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UvssaQ9D479 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UvssaQ9D479 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UvssaQ9D479 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UvssaQ9D479 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UvssaQ9D479 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UvssaQ9D479 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UvssaQ9D479 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UvssaQ9D479 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UvssaQ9D479 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UvssaQ9D479 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UvssaQ9D479 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UvssaQ9D479 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UvssaQ9D479 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UvssaQ9D479 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
UvssaQ9D479 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UvssaQ9D479 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UvssaQ9D479 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UvssaQ9D479 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UvssaQ9D479 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UvssaQ9D479 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
UvssaQ9D479 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UvssaQ9D479 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UvssaQ9D479 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UvssaQ9D479 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UvssaQ9D479 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms