Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pus10Q9D3U0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pus10Q9D3U0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pus10Q9D3U0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pus10Q9D3U0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pus10Q9D3U0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms