Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx29Q9D3S3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snx29Q9D3S3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snx29Q9D3S3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snx29Q9D3S3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx29Q9D3S3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx29Q9D3S3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snx29Q9D3S3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snx29Q9D3S3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snx29Q9D3S3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx29Q9D3S3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snx29Q9D3S3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snx29Q9D3S3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snx29Q9D3S3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snx29Q9D3S3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx29Q9D3S3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx29Q9D3S3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx29Q9D3S3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx29Q9D3S3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx29Q9D3S3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx29Q9D3S3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx29Q9D3S3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx29Q9D3S3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx29Q9D3S3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snx29Q9D3S3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snx29Q9D3S3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snx29Q9D3S3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snx29Q9D3S3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx29Q9D3S3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snx29Q9D3S3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx29Q9D3S3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx29Q9D3S3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx29Q9D3S3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms