Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Stag1Q9D3E6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Stag1Q9D3E6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stag1Q9D3E6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stag1Q9D3E6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stag1Q9D3E6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stag1Q9D3E6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stag1Q9D3E6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stag1Q9D3E6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stag1Q9D3E6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stag1Q9D3E6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stag1Q9D3E6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stag1Q9D3E6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stag1Q9D3E6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stag1Q9D3E6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stag1Q9D3E6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stag1Q9D3E6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stag1Q9D3E6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stag1Q9D3E6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stag1Q9D3E6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stag1Q9D3E6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stag1Q9D3E6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stag1Q9D3E6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stag1Q9D3E6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Stag1Q9D3E6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stag1Q9D3E6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stag1Q9D3E6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Stag1Q9D3E6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Stag1Q9D3E6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Stag1Q9D3E6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Stag1Q9D3E6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Stag1Q9D3E6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stag1Q9D3E6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stag1Q9D3E6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stag1Q9D3E6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stag1Q9D3E6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stag1Q9D3E6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stag1Q9D3E6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stag1Q9D3E6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stag1Q9D3E6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stag1Q9D3E6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stag1Q9D3E6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stag1Q9D3E6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stag1Q9D3E6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Stag1Q9D3E6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stag1Q9D3E6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms