Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Batf3Q9D275 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Batf3Q9D275 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Batf3Q9D275 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Batf3Q9D275 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Batf3Q9D275 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Batf3Q9D275 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Batf3Q9D275 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Batf3Q9D275 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Batf3Q9D275 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Batf3Q9D275 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Batf3Q9D275 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Batf3Q9D275 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Batf3Q9D275 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms