Protein–RNA interactions for Protein: Q9D260

9230112D13Rik, RIKEN cDNA 9230112D13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230112D13RikQ9D260 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
9230112D13RikQ9D260 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
9230112D13RikQ9D260 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
9230112D13RikQ9D260 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
9230112D13RikQ9D260 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
9230112D13RikQ9D260 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
9230112D13RikQ9D260 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
9230112D13RikQ9D260 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
9230112D13RikQ9D260 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
9230112D13RikQ9D260 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
9230112D13RikQ9D260 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
9230112D13RikQ9D260 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
9230112D13RikQ9D260 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
9230112D13RikQ9D260 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
9230112D13RikQ9D260 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
9230112D13RikQ9D260 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
9230112D13RikQ9D260 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
9230112D13RikQ9D260 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
9230112D13RikQ9D260 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
9230112D13RikQ9D260 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms