Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Chchd2Q9D1L0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chchd2Q9D1L0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chchd2Q9D1L0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chchd2Q9D1L0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chchd2Q9D1L0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chchd2Q9D1L0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chchd2Q9D1L0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms