Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D1K7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D1K7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D1K7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D1K7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D1K7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D1K7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D1K7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D1K7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D1K7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D1K7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D1K7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D1K7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D1K7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D1K7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D1K7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D1K7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D1K7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D1K7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D1K7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D1K7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D1K7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D1K7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D1K7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9D1K7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9D1K7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9D1K7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D1K7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms