Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Susd3Q9D176 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Susd3Q9D176 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Susd3Q9D176 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Susd3Q9D176 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Susd3Q9D176 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Susd3Q9D176 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Susd3Q9D176 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Susd3Q9D176 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Susd3Q9D176 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Susd3Q9D176 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Susd3Q9D176 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Susd3Q9D176 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Susd3Q9D176 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Susd3Q9D176 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Susd3Q9D176 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Susd3Q9D176 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Susd3Q9D176 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Susd3Q9D176 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Susd3Q9D176 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Susd3Q9D176 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Susd3Q9D176 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Susd3Q9D176 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Susd3Q9D176 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Susd3Q9D176 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Susd3Q9D176 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Susd3Q9D176 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Susd3Q9D176 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Susd3Q9D176 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Susd3Q9D176 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Susd3Q9D176 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Susd3Q9D176 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Susd3Q9D176 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Susd3Q9D176 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Susd3Q9D176 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Susd3Q9D176 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Susd3Q9D176 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Susd3Q9D176 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Susd3Q9D176 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Susd3Q9D176 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Susd3Q9D176 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Susd3Q9D176 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Susd3Q9D176 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Susd3Q9D176 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Susd3Q9D176 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Susd3Q9D176 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Susd3Q9D176 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Susd3Q9D176 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Susd3Q9D176 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Susd3Q9D176 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Susd3Q9D176 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Susd3Q9D176 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Susd3Q9D176 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Susd3Q9D176 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Susd3Q9D176 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Susd3Q9D176 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Susd3Q9D176 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Susd3Q9D176 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms