Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU3

Mtrex, Exosome RNA helicase MTR4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrexQ9CZU3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MtrexQ9CZU3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MtrexQ9CZU3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MtrexQ9CZU3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MtrexQ9CZU3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MtrexQ9CZU3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MtrexQ9CZU3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MtrexQ9CZU3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MtrexQ9CZU3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MtrexQ9CZU3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MtrexQ9CZU3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MtrexQ9CZU3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MtrexQ9CZU3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MtrexQ9CZU3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MtrexQ9CZU3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MtrexQ9CZU3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MtrexQ9CZU3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MtrexQ9CZU3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MtrexQ9CZU3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MtrexQ9CZU3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MtrexQ9CZU3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MtrexQ9CZU3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MtrexQ9CZU3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MtrexQ9CZU3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms