Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa9Q9CZN4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisa9Q9CZN4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shisa9Q9CZN4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms