Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mgme1Q9CXC3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgme1Q9CXC3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgme1Q9CXC3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgme1Q9CXC3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgme1Q9CXC3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgme1Q9CXC3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mgme1Q9CXC3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mgme1Q9CXC3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mgme1Q9CXC3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mgme1Q9CXC3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mgme1Q9CXC3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mgme1Q9CXC3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mgme1Q9CXC3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mgme1Q9CXC3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Mgme1Q9CXC3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mgme1Q9CXC3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mgme1Q9CXC3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mgme1Q9CXC3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mgme1Q9CXC3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mgme1Q9CXC3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mgme1Q9CXC3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mgme1Q9CXC3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mgme1Q9CXC3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mgme1Q9CXC3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgme1Q9CXC3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms