Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV1

Mcm8, DNA helicase MCM8, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm8Q9CWV1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcm8Q9CWV1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcm8Q9CWV1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcm8Q9CWV1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcm8Q9CWV1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcm8Q9CWV1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcm8Q9CWV1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcm8Q9CWV1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcm8Q9CWV1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcm8Q9CWV1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcm8Q9CWV1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcm8Q9CWV1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcm8Q9CWV1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcm8Q9CWV1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mcm8Q9CWV1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mcm8Q9CWV1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcm8Q9CWV1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcm8Q9CWV1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcm8Q9CWV1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm8Q9CWV1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm8Q9CWV1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm8Q9CWV1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm8Q9CWV1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm8Q9CWV1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm8Q9CWV1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcm8Q9CWV1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.6 ms