Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot11Q9CWN7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot11Q9CWN7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot11Q9CWN7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms