Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930553M12RikQ9CUH1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
4930553M12RikQ9CUH1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930553M12RikQ9CUH1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930553M12RikQ9CUH1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930553M12RikQ9CUH1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930553M12RikQ9CUH1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
4930553M12RikQ9CUH1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930553M12RikQ9CUH1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930553M12RikQ9CUH1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930553M12RikQ9CUH1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930553M12RikQ9CUH1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930553M12RikQ9CUH1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930553M12RikQ9CUH1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930553M12RikQ9CUH1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930553M12RikQ9CUH1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930553M12RikQ9CUH1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930553M12RikQ9CUH1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930553M12RikQ9CUH1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930553M12RikQ9CUH1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930553M12RikQ9CUH1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930553M12RikQ9CUH1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930553M12RikQ9CUH1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930553M12RikQ9CUH1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930553M12RikQ9CUH1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930553M12RikQ9CUH1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms